蔡泽坪课题组（海南大学热带农林学院）
简介和师资 大创项目 本科生发表论文 本科生竞赛获奖 本科生风采 条件与保障 |
创客空间简介
为深入贯彻落实《国务院关于推动创新创业高质量发展打造“双创”升级版的意见》和《国务院办公厅关于进一步支持大学生创新创业的指导意见》，根据《海南大学大学生创新创业重点团队建设管理办法（试行）》（海大教[2022]69号）文件要求。本团队申请并创立了植物基因组学与生物大数据挖掘创客空间。
海南大学创客空间作为创新创业教育的载体之一，应充分发挥引导大学生参与创新创业实践活动的功能，将创意、创新与专业知识、生活实际相结合，引导大学生将奇思妙想转化为现实产品，提供专创融合、科创融合开放的多元化服务。
教育理念
1. 跨学科融合教育
本团队强调植物基因组学、生物信息学、大数据分析等多学科的交叉融合，通过提供跨学科的课程和实践项目，帮助学生构建全面的知识体系，培养具备多学科背景的复合型人才。
2. 创新与实践能力培养
本团队注重培养学生的创新思维和实践能力。通过引导学生参与科研项目、开展实验设计、分析生物大数据等实践活动，培养学生的独立思考、解决问题的能力，以及团队协作和沟通的能力。
3. 数据驱动的研究方法
在生物大数据时代，数据驱动的研究方法成为植物基因组学研究的重要手段。本团队致力于教授学生如何运用大数据分析工具和技术，挖掘植物基因组数据中的有价值信息，推动植物科学研究的进展。
4. 开放与合作的研究氛围
团队倡导开放、合作的研究氛围，鼓励学生之间的交流和合作，以及与其他研究团队的交流合作。通过分享研究经验、讨论问题、共同解决难题，提高学生的研究水平和团队协作能力。
综上所述，本团队的教育理念注重跨学科融合、创新与实践能力培养、数据驱动的研究方法以及开放与合作的研究氛围的理念，旨在培养具备全面素质和创新能力的植物基因组学和生物大数据挖掘领域的优秀人才。
建设方案
1. 建设目标
团队在建设期内指导学生以第一作者或共同第一作者完成发表高质量SCI论文1-2篇、申报国家级项目1-2项、参与创新创业相关比赛获省级及以上奖项。
2. 方案设计
主要针对木棉、肾茶、扇叶铁线蕨和木豆等，开展药用植物资源的开发保护与利用，关注物种多样性保护，研究自然资源的合理利用和管理；药用植物基因组学和生物大数据挖掘与基因功能的研究；植物类黄酮合成功能基因挖掘，与基因的表达调控。
3. 可行性分析
植物基因组学和生物大数据挖掘是生物学领域中的两个重要研究方向，而创客空间团队建设则是一个集结人才、资源和技术，以实现共同目标和创新发展的有效方式。
从学科交叉的角度来看，植物基因组学和生物大数据挖掘存在天然的互补性。植物基因组学主要研究植物基因组的组成、结构和功能，而生物大数据挖掘则专注于从海量的生物学数据中提取有用信息。这两个领域都需要深入的生物学知识、数据处理和分析技能，以及创新的研究思路。因此，将这两个领域结合起来，可以形成一支具备多学科背景的团队，从而推动植物基因组学研究的深入发展。
此外，从技术和资源的角度来看，本团队配备有先进的实验设备、实验材料以及超过80 m2的实验用地，可以满足团队成员开展植物基因组学和生物大数据挖掘研究的需求。同时，本团队具有高水平教师3名，可以指导学生项目申报与合作，带领学生参与创新创业大赛，为团队建设提供良好的发展环境。
因此，本创客空间团队建设具有较大的可行性。通过整合学科资源、汇聚人才力量、利用技术和资源支持，可以推动植物基因组学和生物大数据挖掘研究的深入发展。
师资队伍
本团队目前由4名教师组成，专注于木棉、肾茶、扇叶铁线蕨和木豆等药用植物的研究。目前在研的纵向项目2项，总经费共计137万元，其中海南省重大科技专项子课题1项，单项经费达130万元。
团队带头人：蔡泽坪，副教授，致力于植物遗传改良与逆境生物学研究，以及植物比较基因组学与生物大数据挖掘。
团队成员1：于旭东，副教授，主要从事肾茶化学成分及其生物活性研究，以及木棉遗传特性分析研究等；
团队成员2：徐诗涛，副教授，主要从事热带植物资源保护与开发。
团队成员3：罗佳佳，副研究员，主要从事狼尾草非生物逆境胁迫（低磷和盐害）响应机制及分子育种研究。
团队成员作为指导老师，已指导大学生创新创业训练计划项目23项，其中国家级项目11项（包括国家级重点领域项目1项），省级项目8项，校级项目4项。
国家级：
1. 大学生创新训练计划项目（国家级，重点领域），光照调控扇叶铁线蕨配子体发育的分子机制研究，2023/06/01-2024/06/01，已结题，项目负责人：张语歌，指导老师：蔡泽坪。
2. 大学生创新训练计划项目（国家级），王草紫色酸性磷酸酶 PpPAP17a参与磷素利用的机制研究，2024/06/01-2025/06/01，在研，项目负责人：毛昱烨，指导老师：蔡泽坪。
3. 大学生创新训练计划项目（国家级），BRs调控水稻根不对称生长的分子机理 ——以水稻为例，2024/06/01-2025/06/01，在研，项目负责人：李沛研，指导老师：徐诗涛。
4. 大学生创新训练计划项目（国家级），整合代谢组学和转录组学分析揭示木棉花色调控的分子机制，2024/06/01-2025/06/01，在研，项目负责人：韩雨彤，指导老师：于旭东。
5. 大学生创新训练计划项目（国家级），磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶 PpPEPC1b 磷酸化修饰调控巨菌草适应低磷胁迫的分子机制研究，2024/06/01-2025/06/01，在研，项目负责人：郭雨彤，指导老师：蔡泽坪。
6. 大学生创新训练计划项目（国家级），木棉优良品种的繁殖技术研究及推广，2022/06/01-2023/06/01，已结题，项目负责人：李文轩，指导老师：于旭东。
7. 大学生创新训练计划项目（国家级），BRs调控根不对称生长的分子机理——以水稻为例，2021/06/01-2022/06/01，已结题，项目负责人：黄璐瑶，指导老师：蔡泽坪。
8. 大学生创新训练计划项目（国家级），白化菠萝蜜突变体叶的蛋白激酶和转录因子家族基因表达分析，2021/06/01-2022/06/01，已结题，项目负责人：高淑怡，指导老师：于旭东。
9. 大学生创新训练计划项目（国家级），环境温度通过乙烯途径调控水稻根不对称生长的RNA-Seq分析，2020/06/01-2021/06/01，已结题，项目负责人：姜庚博，指导老师：蔡泽坪。
10. 大学生创新训练计划项目（国家级），白化菠萝蜜抗性基因的筛选及功能分析，2020/06/01-2021/06/01，已结题，项目负责人：张西，指导老师：于旭东。
11. 大学生创新训练计划项目（国家级），“岸芷汀兰”兰花盆景工作室，2019/06/01-2020/06/01，已结题，项目负责人：许心诺，指导老师：蔡泽坪。
省级：
1. 大学生创业训练计划项目（省级），“医”脉相承：中医诊疗现代化探索者，2024/06/01-2025/06/01，在研，项目负责人：吴戈，指导老师：于旭东。
2. 海南省普通高等学校研究生创新科研课题（省级），决明类查尔酮合酶参与蒽醌合成的功能研究，2023/01/01-2024/12/31，已结题，项目负责人：方婷，指导老师：蔡泽坪。
3. 大学生创新训练计划项目（省级），决明串联重复基因的全基因组的分析，2022/06/01-2023/06/01，已结题，项目负责人：郭艺，指导老师：于旭东。
4. 大学生创新训练计划项目（省级），白化病影响菠萝蜜叶气孔和表皮扁平细胞发育的转录调控机制，2019/06/01-2021/06/01，已结题，项目负责人：瞿倩，指导老师：蔡泽坪。
5. 大学生创新训练计划项目（省级），膜覆盖技术在杂草防治中的应用研究，2018/06/01-2019/06/01，已结题，项目负责人：李家豪，指导老师：于旭东。
6. 大学生创新训练计划项目（省级），“兴飞”盆栽工艺坊，2018/06/01-2019/06/01，已结题，项目负责人：汪尧，指导老师：于旭东。
7. 大学生创新训练计划项目（省级），油菜素内酯影响蕨类植物配子体生长的转录调控机制——以扇叶铁线蕨为例，2018/06/01-2019/06/01，已结题，项目负责人：汪金梅，指导老师：蔡泽坪。
8. 大学生创新训练计划项目（省级），南非叶外植体（根）愈伤组织快繁研究，2018/06/01-2019/06/01，已结题，项目负责人：黄楚君，指导老师：徐诗涛。
校级：
1. 大学生创新训练计划项目（校级），油菜素甾醇调控水稻根不对称生长的分子机制研究，2019/06/01-2021/06/01，已结题，项目负责人：金霞，指导老师：蔡泽坪。
2. 大学生创新训练计划项目（校级），白化病对菠萝蜜维管组织发育的影响及其分子调控机制研究，2019/06/01-2021/06/01，已结题，项目负责人：董俊娜，指导老师：于旭东。
3. 大学生创新训练计划项目（校级），201910589418，BR信号对扇叶铁线蕨配子体发育的分子调控机制，2019/06/01-2020/06/01，已结题，项目负责人：付婷，指导老师：蔡泽坪。
4. 大学生创新训练计划项目（校级），BRs影响扇叶铁线蕨配子体发育的转录机制，2019/06/01-2020/06/01，已结题，项目负责人：牛文辉，指导老师：蔡泽坪。
团队成员已指导本科生以第一作者或共同第一作者发表中文核心期刊以上论文31篇，包括SCI论文8篇（一区2篇；三区3篇；四区3篇），CSCD 6篇，北大核心期刊论文17篇。所有论文，本科生均排名第一名或共同第一作者，且海南大学为第一单位。
SCI论文8篇：
[1] Cai ZP#（蔡泽坪）, Dai YN#（戴一诺, 本科生）, Jin X#（金霞, 本科生）, Xu H#（许晖, 本科生）, Huang Z（黄禛, 本科生）, Xie ZY, Yu XD and Luo JJ*. Ambient temperature regulates root circumnutation in rice through the ethylene pathway: transcriptome analysis reveals key genes involved [J]. Front. Plant Sci., 2024, 15: 1348295. doi: 10.3389/fpls.2024.1348295.（3名本科生为共同第一作者，海南大学为第一单位，SCI一区，IF：5.6）
[2] Cai ZP#（蔡泽坪）, Wang XC#（王晓晨, 本科生）, Xie ZY, Wen ZY（文贞懿, 本科生）, Yu XD, Xu ST, Su XY（苏心雨, 本科生） and Luo JJ*. Light response of gametophyte in Adiantum flabellulatum: transcriptome analysis and identification of key genes and pathways [J]. Front. Plant Sci., 2023, 14: 1222414. doi: 10.3389/fpls.2023.1222414.（本科生为共同第一作者，海南大学为第一单位，SCI一区，IF：5.6）
[3] Cai ZP#（蔡泽坪）, Xie ZY#, Wang XC#（王晓晨, 本科生）, Zhang SX#（张水仙, 本科生）, Wu Q（吴芊, 本科生）, Yu XD; Guo Y（郭艺, 本科生）, Gao SY（高淑怡, 本科生）, Zhang YG（张运歌, 本科生）, Xu ST, Wang HG, Luo JJ*. Excavation of Genes Responsive to Brassinosteroids by Transcriptome Sequencing in Adiantum flabellulatum Gametophytes [J]. Genes, 2022, 13: 1061.（2名本科生为共同第一作者，海南大学为第一单位，SCI三区，IF：4.141）
[4] Cai ZP#（蔡泽坪）, Xie ZY#, Huang LY#（黄璐瑶, 本科生）, Wang ZX（王紫璇, 本科生）, Pan M（潘敏, 本科生）, Yu XD, Xu ST, Luo JJ*. Full-length transcriptome analysis of Adiantum flabellulatum gametophyte [J]. Peer J, 2022 10: e13079.（本科生为共同第一作者，海南大学为第一单位，SCI三区，IF：3.061）
[5] Cai ZP#（蔡泽坪）, Huang Z#（黄禛, 本科生）, Wang ZX（王紫璇, 本科生）, Tao Y（陶瑜, 本科生）, Wu FH, Yu XD, Luo JJ*. Identification of the related genes on the asymmetric root growth of Oryza sativa induced by ethylene through transcriptome sequencing, GO and KEGG analysis [J]. Acta Physiologiae Plantarum, 2021, 43(7): 99. doi:10.1007/s11738-021-03271-9..（2名本科生为共同第一作者，海南大学为第一单位，SCI三区，IF：2.736）
[6] Cai ZP#（蔡泽坪）, Huang Z#（黄禛, 本科生）, Huang CJ#（黄楚君, 本科生）, Jin X（金霞, 本科生）, Yang W（杨文, 本科生）, Jiang GB（姜庚博, 本科生）, Wang ZX（王紫璇, 本科生）, Wu FH, Yu XD, Luo JJ*. Transcriptome analysis on asymmetric root growth of Oryza sativa Induced by brassinosteroids via ethylene pathway [J]. J. Plant Biol, 2021, 64: 349-358.（本科生为共同第一作者，海南大学为第一单位，SCI四区，IF：3.15）
[7] Liang JW#, Yang J#, Yev ZH#（叶子涵, 本科生）, Cai ZP（蔡泽坪）, Xu ST*, Wang P, and Yu XD. Response of Asplenium nidus to Drought Stress and Roles of AVP1 Genes [J]. American Fern Journal, 2023, 113(1): 14-27. https://doi.org/10.1640/0002-8444-113.1.14. （本科生叶子涵为共同第一作者，海南大学为第一单位，SCI四区，IF：0.676）
[8] Cai ZP#（蔡泽坪）, Yang W#（杨文, 本科生）, Zhang HY（张涵越, 本科生）, Luo JJ, Wu FH, Jing X, Meng SL（孟帅良, 本科生）, Wang XY, Yu XD . Ethylene participates in the brassinolide-regulated asymmetric growth of O. sativa root [J]. South African Journal of Botany, 2018, 119: 86-93.（本科生为共同第一作者，海南大学为第一单位，SCI四区，IF：3.1）
团队带头人蔡泽坪以第一指导老师已指导本科生获2020年美国大学生数学建模大赛Successful Participant奖、第十一届“挑战杯”海南省大学生课外学术科技作品竞赛省赛三等奖（省级）、第十八届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛校赛二等奖和三等奖、第十四届中国大学生创业计划竞赛海南大学校内选拔赛铜奖。
（1）2020年，楚文清（本科生），美国大学生数学建模大赛Successful Participant奖，指导老师：蔡泽坪
（2）2023年，许晖（本科生），第十一届“挑战杯”海南省大学生课外学术科技作品竞赛省赛三等奖（省级），作品名称为《环境温度通过乙烯途径调控水稻根回旋生长的生理作用及其核心基因筛选与分析》，指导老师：蔡泽坪
（3）2023年，许晖（本科生），第十八届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛海南大学校内选拔赛二等奖，作品名称为《环境温度通过乙烯途径调控水稻根回旋生长的生理作用及其核心基因筛选与分析》，指导老师：蔡泽坪
（4）2023年，王晓晨（本科生），第十八届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛海南大学校内选拔赛三等奖，作品名称为《扇叶铁线蕨配子体的光响应：转录组分析及关键基因和通路鉴定》，指导老师：蔡泽坪
（5）2024年，吴戈（本科生），第十四届中国大学生创业计划竞赛海南大学校内选拔赛中荣获铜奖，作品名称为《"医”脉相承： 中医理疗现代服务领航者》，指导老师：蔡泽坪
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保研：北京大学
保研：复旦大学
保研：浙江大学
保研：浙江大学
保研：浙江大学
保研：浙江大学
保研：南京大学
保研：中国科学院大学
保研：中山大学
保研：中山大学
保研：厦门大学
保研：厦门大学
保研：四川大学
保研：四川大学
保研：北京理工大学
保研：北京理工大学
保研：华中农业大学
保研：华中农业大学
保研：中国农业大学
保研：中国农业大学
保研：中国农业大学
保研：中国农业大学
保研：中国农业大学
保研：海南大学
（A）荧光定量PCR仪；（B）激光共聚焦显微镜；（C）凝胶成像系统；（D）超高速离心机；（E）扫描电子显微镜；（F）荧光显微镜
（A）~（H）大创工作室;（F）植物培养室
硬件设施条件：本团队依托依托“热带特色林木花卉遗传与种质创新”教育部重点实验室，使用面积超过100 ㎡。配备实时荧光定量PCR仪、体式显微镜、荧光显微镜、高速离心机、超低温冰箱、摇床、超净工作台、凝胶成像系统和高性能计算机工作站等植物基因组学分析和生物大数据挖掘所需的基本仪器设备。
管理与运行：建立实验室管理制度和仪器使用规范条例，包括实验室管理总则、实验设备管理和使用规则、实验材料管理规则、实验室卫生和安全管理规则。设置考核与奖励机制，从工作、实验设备维护、现场卫生和仪器药品使用情况四大方面进行考核并设立奖励。
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