蔡泽坪课题组
(海南大学热带农林学院)

植物比较基因组学与生物大数据挖掘

通过整合基因组学、生物信息学和计算生物学的手段,对植物比较基因组学与生物大数据挖掘进行深入研究。从而揭示不同植物物种在基因组结构、功能基因、调控元件等方面的异同。跨物种的比较分析有助于理解植物基因组的进化历程,以及不同植物在适应环境、抵抗逆境等方面的遗传机制。关注基因组变异与表型变异之间的关系目标如下

(1)揭示植物基因组与环境的相互作用机制,开发高效的作物遗传改良技术。

(2)揭示植物在适应不同环境条件下的遗传基础,为作物抗逆性、产量和品质等性状的改良提供新的思路和方法。

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全基因组鉴定和分析III型聚酮合酶(PKS)超家族基因

aIIIPKS超家族基因在决明和其豆科植物中的系统发育关系及数量。(b)决明基因组中IIIPKS基因的分布结构。左侧显示基因所在的连锁群,中间位置展示IIIPKS基因的ID和结构,左侧给出Pfam预测的结构域。(c根的系统发育树显示了来自决明、大豆、拟南芥和苜蓿的IIIPKS蛋白序列的进化关系。带有红色的基因ID代表决明基因组中的串联重复基因


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